O Ekos Brasil foi criado em agosto de 2001, por iniciativa do geólogo suíço-brasileiro Ernesto Moeri, para a preservação da biodiversidade e a promoção da sustentabilidade.
Suas primeiras ações se concentraram na promoção de tecnologias inéditas no Brasil de remediação in situ de áreas contaminadas, estabelecendo para isso, desde 2002, parcerias com empresas e organizações nacionais e internacionais focadas na realização do Seminário Internacional sobre Remediação de Áreas Contaminadas. A 12ª edição do Seminário ocorreu em Outubro de 2020 em formato online e foi um grande sucesso, contando com uma importante discussão focada na disponibilidade hídrica da Região Metropolitana de São Paulo e a proposição de um Programa Regional de Manejo da Qualidade da Água Subterrânea para o bairro Jurubatuba, localizado no município de São Paulo. Participaram do evento convidados de variadas organizações e países, com representatividade de importantes setores relacionados ao tema. O evento também se firmou, ao longo dos anos, como o mais importante de sua área na América Latina.
Instituto Ekos Brasil não possui atualmente nenhuma vaga ativa na plataforma de contractualisation de desenvolvedores ProgramaThor.
A empresa Instituto Ekos Brasil foi criada em 2002.
